Stefan Rafiński to zasłużony chełmiński biograf, historyk i regionalista.
Jest autorem wielu książek i artykułów naukowych.
W Książnicy Kopernikańskiej dostępne są jego następujące publikacje:
- Bonifacy Łazarewicz / Stefan Rafiński. - Grudziądz : Polskie Towarzystwo Historyczne 1978.
- Chełmiński słownik biograficzny. T. 2 / Stefan Rafiński. - Chełmno : Wydawnictwo Muzeum Ziemi Chełmińskiej 2015.
- Chełmiński słownik biograficzny / Stefan Rafiński. - Chełmno : Wydawnictwo Muzeum Ziemi Chełmińskiej 2006.
- Dr Jan Sujkowski, lekarz i działacz narodowy na Pomorzu / Stefan Rafiński. - Grudziądz : Polskie Towarzystwo Historyczne, 1976.
- Mały słownik biograficzny uczniów Gimnazjum Chełmińskiego z XIX i pocz. XX w. / Stefan Rafiński. - Chełmno : Wydawnictwo Muzeum Ziemi Chełmińskiej 2020.
- Mieczysław Łyskowski / Stefan Rafiński. - Grudziądz : Polskie Towarzystwo Historyczne, 1978.
- Nauczanie języka polskiego w gimnazjum chełmińskim w latach 1840-1849 / Stefan Rafiński. - Toruń : UMK 1971.
- Nieznane przyczynki do biografii prof. dr. med. Ludwika Rydygiera / Stefan Rafiński. - Warszawa : PWN, 1978.
- Objazdowa działalność Teatru Miejskiego w Grudziądzu na Pomorzu w okresie międzywojennym / Stefan Rafiński ; Gdańskie Towarzystwo Naukowe Wydział I Nauk Społecznych i Humanistycznych. - Gdańsk : Gdańskie Towarzystwo Naukowe, 1990.
- Portret zapomnianego dziennikarza pomorskiego Jana Michała Rakowskiego / Stefan Rafiński. - Grudziądz : Polskie Towarzystwo Historyczne, 1979.
- Władysław Cieszyński, dziennikarz i działacz gdański / Stefan Rafiński. - Gdańsk : Gdańskie Towarzystwo Naukowe, 1975.
- Z dziejów Gimnazjum i Liceum Ogólnokształcącego w Chełmnie / Stefan Rafiński. - Bydgoszcz : Bydgoskie Towarzystwo Naukowe, 2001.
Szczególnym zainteresowaniem Stefana Rafińskiego cieszyła się zawsze biografistyka.
Jego dziełem jest dwutomowy "Chełmiński Słownik Biograficzny"
Tom pierwszy ukazał się w 2006 roku i liczył 325 sylwetek osób niepospolitych związanych życiem i działalnością z Chełmnem.
Tom drugi "Chełmińskiego Słownika Biograficznego" został wydany w 2015 roku.
Obejmuje on kolejnych 190 życiorysów wybitnych chełminiaków.
Słownik prezentuje osoby wyróżniające się w dziedzinie nauki, muzyki, sztuki, medycyny, oświaty, prawa i walki o niepodległość.
Ważne miejsce w II tomie zajęli maturzyści Gimnazjum Chełmińskiego.
Byli to zwłaszcza przyszli duchowni, którzy w okresie zaborów mieli największe możliwości oddziaływania na społeczeństwo poprzez szerzenie oświaty, mecenat nad organizacjami narodowymi oraz instytucjami o charakterze gospodarczym.
Wśród maturzystów wyróżniali się też członkowie Korpusu Kadetów, którzy chlubnie zapisali się walcząc bohatersko na frontach drugiej wojny światowej.
W słowniku znaleźli się też chełmińscy kasztelanowie, podkomorzowie, sędziowie ziemscy z okresu staropolskiego.
Uwzględniono działalność Zgromadzenia Sióstr Miłosierdzia w Chełmnie.
Nie zapomniano o profesorach Akademii Chełmińskiej.
Kontynuacją "Chełmińskiego Słownika Biograficznego" (tom i i II) jest "Mały słownik biograficzny uczniów Gimnazjum Chełmińskiego z XIX i pocz. XX w.", w którym znalazło się 51 biogramów absolwentów Gimnazjum Chełmińskiego.